“鬼船”入港引發恐慌，上司為自保欲以“水匪之亂”結案，狄仁杰察覺疑點重重。適逢大典將至，長安動蕩不安，皇后強令大理寺沈銘三日內破案，重壓之下狄仁杰被迫接下重任。督水監冷霽月與舊識段言于案發船只重逢后，三人共同深入調查，潛入長安地下情報中樞“下城”獲取關鍵線索。循跡追查中揭開長安地下兩大勢力操控的隱秘據點——云窟，狄仁杰等冒險闖入古陵云窟破解重重機關，在絕境中憑借土層辨識尋得出路，最終于陽墓發現陰墓所在。真相顯現：懷王與大月遺族借飼養龍鰲圖謀復國之亂，欲借大典時機發動突襲。狄仁杰識破陰謀后暗布天羅地網，于慶典當日將潛伏勢力一網打盡。