林肯（伊萬·麥克格雷格飾）和喬丹（斯嘉麗·約翰遜飾）生活在一個與世隔絕的地下社區，科學家宣稱他們是地球最后幸存的人類。每當抽簽選出"幸運者"前往傳說中的世外桃源島時，群體成員都陷入對自由的渴望與等待。兩人意外獲選后，在前往島嶼途中逐漸發現異常：他們被禁止接觸外部世界，所有日常活動都受到嚴密監控。當林肯目睹好友在所謂"凈化手術"中被活體解剖后，終于識破殘酷真相——所謂的島嶼是克隆人器官收割場，所有居民都是富豪權貴的生物備件。這對戀人鋌而走險逃離設施，在洛杉磯找到他們的"贊助人"，通過媒體向公眾揭露這個建立在克隆技術上的黑暗產業。隨著真相曝光，政府開始調查幕后黑手，而林肯與喬丹作為最早覺醒的克隆人，在聯邦機構保護下獲得真正的自由。