小智一行人在海上遭遇風(fēng)暴后漂流至亞西亞島，正逢當(dāng)?shù)鼗I備慶典。圣女弗盧拉指定小智擔(dān)任慶典"指揮者"，需前往三圣島集齊象征風(fēng)、雷、冰的三顆玻璃球才能開(kāi)啟儀式。眾人在尋找過(guò)程中接連遭遇火箭隊(duì)阻撓與閃電鳥(niǎo)襲擊，神秘女子吉爾露突然現(xiàn)身捕獲閃電鳥(niǎo)，并試圖捕捉急凍鳥(niǎo)以實(shí)現(xiàn)召喚傳說(shuō)寶可夢(mèng)洛奇亞的計(jì)劃。當(dāng)火焰鳥(niǎo)、閃電鳥(niǎo)與急凍鳥(niǎo)因吉爾露的挑撥爆發(fā)激烈沖突時(shí)，三圣獸的戰(zhàn)斗波動(dòng)意外引發(fā)海嘯危機(jī)。最終洛奇亞從深海破水而出，以絕對(duì)力量震懾三圣獸平息紛爭(zhēng)，小智等人成功尋獲全部玻璃球并完成慶典儀式。