經(jīng)過厚生省官員白鳥圭輔（仲村亨飾）和東城大學附屬醫(yī)院醫(yī)生田口公平（伊藤淳史飾）的努力，日本引進首臺新型核磁共振成像儀器"利維坦"。與此同時，某高級別墅地下室發(fā)生九人離奇死亡事件，其中厚生省唯一支持引進利維坦的船橋審議官死于現(xiàn)場。海歸教授東堂文昭（生瀬勝久飾）利用利維坦查明死因為氰化物中毒，卻因異常執(zhí)著引發(fā)白鳥對其動機的懷疑。在Ai中心研討會前夕，田口收到威脅摧毀"三頭犬之塔"——利維坦的恐嚇信，通過與記者別宮葉子（桐谷美玲飾）的合作調查，發(fā)現(xiàn)系列事件矛頭指向因白鳥圭輔過往醫(yī)療決策而家破人亡的櫻宮堇（栗山千明飾）。隨著倒計時推進，白鳥與田口在Ai中心展開生死對峙，最終通過解除炸彈裝置使利維坦得以保存。櫻宮堇在與白鳥當面對質后選擇自殺，其遺言揭露了醫(yī)療體系深層矛盾對個體命運的殘酷碾壓。