深眠于地殼深處的遠古巨型怪獸因不明原因陸續蘇醒，引發全球性地震、海嘯與火山爆發等連鎖災難。怪獸生態學家艾略特·布雷克博士發現所有災變均與遠古超大陸板塊移動存在關聯，通過破譯海底遺跡圖騰揭示出怪獸蘇醒的周期性規律。在聯合太平洋防衛部隊阻止火山口巨型蛋孵化的任務中，布雷克團隊意外發現人類早期基因實驗遺留的生物兵器才是觸發怪獸覺醒的核心誘因。隨著南極洲最后一只冰凍泰坦的蘇醒，布雷克利用聲波共振裝置引導怪獸回歸地幔層，在摧毀核心控制塔后所有泰坦同步陷入休眠，地球重新恢復地質穩定。