在《偽裝者第二季》中，天才模仿者賈羅德繼續利用其超凡能力幫助普通人，他先后偽裝成解剖學專家、保險箱竊賊、救險隊員、時尚攝影師等多種身份，調查了一系列案件，包括尋找失蹤學生、為無辜者洗刷冤屈以及揭露死亡真相。與此同時，中心對他的追捕也在持續，帕克小姐在尋找失蹤父親的過程中，從母親朋友處獲得了驚人線索，并與萊爾先生及清潔工布麗吉特形成對立。悉尼和布魯茨則各自面臨來自雷恩斯先生的審查與過去陰影的困擾。本季中，賈羅德與中心的對抗進一步升級，他試圖阻止萊爾濫用其編寫的程序，并回憶起自己被中心誘拐的童年經歷。帕克小姐發現了地下27層的更多秘密，并意外得知自己可能有一個雙胞胎兄弟。而雷恩斯先生則計劃重啟偽裝者項目。多條故事線在銀行劫案等人質事件中交織，人物關系與過往謎團逐漸展開。