在并不遙遠的未來，人類文明高度發達，外星殖民不再是幻想。然而相對高度發達的科技，娛樂事業卻受到前所未有的壓制。藝能活動被認為具有蠱惑和腐蝕人心的惡劣影響而遭到當局禁止。好在渴望娛樂的種子仍在發芽，名為AKB0048的偶像團體繼承地球時代原組合的精神遺產，志愿為所有藍花星的人民送去快樂和夢想。她們頂住當局的壓力舉行非法演唱會，并公開招募第77期研究生。受到偶像感召，本宮凪沙（巖田華憐配音）、園智惠理（渡邊麻友配音）、藍田織音（仲谷明香配音）、橫溝真琴（三田麻央配音）等滿懷青春夢想的女孩相繼報名。突破當局的層層限制和一道又一道選拔考驗，少女們最終成功登上舞臺，在藍花星各地展開巡回演出，用歌聲與舞蹈喚醒人們對自由的向往。隨著第77期生的成長軌跡展開，偶像團體對當局禁令的反抗也逐漸升華為守護文化傳承的精神抗爭。