妓院高級妓女突然失蹤，李府公子不幸慘死荒野，而李家卻將其草草埋葬。發現異常的宋慈派人晝夜監視李府，不料李府上下幾十口人在眾目睽睽之下變成草人。就在宋慈疑惑之際，通古縣再次發生草人殺人事件。面對毫無線索的案件、同僚的惡意破壞和朝廷的壓力，宋慈憑借其敏銳的洞察力，在驗尸過程中發現死者體內存在特殊毒質，并通過草人制作手法關聯到二十年前晟王奪位被殺案。最終揭露事件背后隱藏的巨大陰謀：原來是晟王夫人家族為報滅門之仇，秘密訓練草人殺手組織，利用毒藥與傀儡術制造連環命案以掩護刺駕計劃。宋慈通過破解毒理真相與兇手動機，成功阻止了針對皇帝的刺殺行動，并將幕后主使繩之以法。