在曼哈頓接連發生離奇死亡事件后，昆蟲學家夫婦蘇珊（米拉·索維諾飾）和皮特（杰瑞米·諾森飾）意外發現罪魁禍首竟是自己為對抗疫情研發的人造昆蟲"猶大"。這種原本設計用于消滅蟑螂的基因改造生物，因未知變異獲得了自主繁殖能力并進化出擬態人形的狩獵本能。隨著地鐵系統專家雷納德（查爾斯·達頓飾）提供地下管網情報，三人組深入猶大族群盤踞的廢棄隧道網絡。在遭遇具備偽裝能力的變異體圍獵過程中，他們逐步揭露猶大族群已建立類社會結構并威脅突破地下屏障。最終行動中，皮特為破壞巢穴核心裝置引爆炸藥與猶大女王同歸于盡，雷納德在通風井阻擊追兵時殉職，蘇珊帶著實驗數據樣本從下水道逃生。黎明時分警戒解除的地鐵站口，渾身濕透的蘇珊將數據交給防疫部門后轉身消失在晨霧中。