柯南、小蘭一行人在米花市市政大廳參加顛覆性游戲"繭"的發布會時，研發負責人堅村突然被殺于地下室。柯南發現死者留在鍵盤上的血跡J、T、R提示指向游戲內部，通過工藤優作的關系與小蘭、灰原哀等獲得體驗資格。當50名玩家進入蠶繭狀膠囊后，人工智能"諾亞方舟"宣布將通過五個歷史場景篩選合格者，淘汰者大腦將被摧毀。柯南團隊與幾名上流社會少年進入19世紀倫敦貝克街副本，遭遇開膛手杰克連環殺人案。通過虛擬世界與現實世界的雙重推理，柯南逐步揭開堅村死亡真相，最終在優作配合下鎖定現實中的兇手，并破解游戲中開膛手杰克的作案手法，成功解救所有被困體驗者。